南方朔1970年代當記者時，常寫文章批評政府或中國國民黨，曾被情治單位盯上。解嚴後南方朔持續批評時政，立場鮮明，也曾引起爭議，他批評前總統陳水扁，也批評前總統馬英九，站在執政者對立面態度堅定。